念珠菌感染通常不会导致胎儿畸形，因为它不会影响胚胎发育。然而，在孕期感染念珠菌时，由于阴道糖原增加，可能会导致异味加重，建议选择透气性好的内衣裤以减轻异味。平时可以使用2%或3%的小苏打水清洗外阴，每晚睡前使用咪糠或克霉唑进行阴道治疗，这样可以治疗念珠菌感染，且不会对胎儿造成影响。

预防胎儿畸形的方法有以下几点：

1. 叶酸对胎儿发育至关重要，最好在备孕前三个月开始服用。这样可以提高卵子质量和胚胎着床发育。怀孕后还需继续服用叶酸，以确保为胎儿提供充足的营养，防止胎儿出现畸形。

2. 怀孕期间应注重身体健康，尽量减少药物服用，如有必要，请咨询医生，以免药物对胎儿产生致畸作用。

3. 远离辐射高的地方，如家中的微波炉和电子产品，以防对胎儿产生影响。

饮食方面：孕期要注意营养均衡，适当补充钙、铁等矿物质，预防缺铁性贫血。进入孕晚期，可适当增加含碘高的食物，如海带、紫菜。在整个孕期，应避免接触有毒有害物质，降低胎儿畸形率的发生，定期进行产前筛查，排除胎儿有畸形的可能。